Na początku swojej działalności Navimor wynajmował pomieszczenia biurowe w gdańskim Heweliuszu. W 1994 roku firma została przeniesiona do Sopotu na Aleję Niepodległości. Cztery lata później została zakupiona działka, na której obecnie zlokalizowana jest siedziba Navimoru. Projekt i nadzór budowlany sprawowany był przez firmę Arkada i Pana W. Łuczyńskiego. W styczniu 2000 roku Navimor zaczął oficjalnie prosperować w nowo wybudowanej siedzibie na ul. Chopina 6. Obecnie połowa budynku jest wynajmowana przez Bank Zachodni WBK i biuro maklerskie WBK.